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【bio-news】我们吃的不是“食物”,是“信息”

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qingfeng822
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肿瘤内科
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呵呵,什么季节吃什么菜呀,不然会干扰信息的
2011-09-22 20:40
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fishbody
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dickzyz
“食物中miRNA含量与在血液及这些器官中出现的含量相关,表明这些miRNA是通过食物摄入的”。
这个推论没有信服力,感觉不像是一般科研手段。要证明进入血液的miRNA来源于食物,一般会用放射性标记或者荧光label之类的来证实。这样没有逻辑的推论居然会出现在Cell Research上,有点吃惊。麻烦把文献名提供以下,让大家查实。
文中应用了测序和PCR的方法来证明血清和组织中的miRNA是植物来源的。用高碘酸氧化方法证明,血中的miRNA不可被氧化的部分是外来植物来源的。
2011-09-22 21:51
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fishbody
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dickzyz
没仔细看,抱歉,应该是肝细胞中的mir level。
但我的疑问,肝细胞中miR168a水平在注射aso后,基本和chow diet 6h持平了吧,这个变化和rice+anti-ncRNA相比,变化在90%左右了。你说的变化在50%左右,是在拿什么做比较?
另外,这个文章做了293T的免疫荧光,弄了那么多老鼠肝组织做qRT-PCR,却没有做miRNA的HRP label。这个就决定了这篇文献只能上Cell Research,而不是Nature。
rna在碱性环境下极易水解,产物是磷酸、嘌呤、嘧啶,是常识吧。没有直接证据,来证明miR-168a来源是口服的,是这篇文章的致命伤。

miRNA如何做HRP的标记?不是很明白。要标记用32P似乎更合适啊。
文中说miRNA是通过胃肠道的吸收然后被MVs包装释放入血的。模拟胃肠道的环境用的是PH2.0的酸性环境,且miRNA168a在煮过的大米中也稳定。也就是说高温和酸性环境都无法使得miRNA168a降解,碱性环境的降解没什么关系。
2011-09-22 22:02
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Jimmy0909
Jimmy0909
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dickzyz
没仔细看,抱歉,应该是肝细胞中的mir level。
但我的疑问,肝细胞中miR168a水平在注射aso后,基本和chow diet 6h持平了吧,这个变化和rice+anti-ncRNA相比,变化在90%左右了。你说的变化在50%左右,是在拿什么做比较?
另外,这个文章做了293T的免疫荧光,弄了那么多老鼠肝组织做qRT-PCR,却没有做miRNA的HRP label。这个就决定了这篇文献只能上Cell Research,而不是Nature。
rna在碱性环境下极易水解,产物是磷酸、嘌呤、嘧啶,是常识吧。没有直接证据,来证明miR-168a来源是口服的,是这篇文章的致命伤。
你看图5了吗?chow diet与rice中miR168a水平相差6倍,是完全不同的两种饲料。注射ASO都是在喂食rice的条件下比较的,rice与rice+ASO比较。

你说293T的实验是指那个荧光酶(luciferase)活性的实验吗?我在本文中看到用这种细胞构建LDLRAP1表达系统以检测miRNA对其影响的实验,不知你说的免疫荧光是哪个图?另,miRNA的HRP label?这是什么实验?请说明一下。

证明miRNAs来自口服分五部分,第一步(图一)半定量RT-PCR、NB证明动物和人血清中存在植物来源的miRNAs,再用两种方法证明实验动物各种组织中存在植物来源的miRNAs(Solexa sequencing,qRT-PCR);第二步证明喂食后血清、肝中这些miRNAs升高与喂食时间有关(图二);第三步用氧化法证明升高的miRNAs来源于植物,因为动物来源的RNAs对氧化敏感(图一);第四步证明未检测到植物来源的miRNAs相应的前体RNAs(图S2B) ,而向肝肿瘤细胞HepG2中转入前体则可以处理为成熟的miRNAs(图3B);第五步证明成熟的miRNA很稳定,而前体不稳定(图S2)。我个人认为证明已经相当充分了,你认为再用什么来证明比较好?
2011-09-23 00:17
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